Es wurde immer nur ein Video im VLC-Player wiedergegeben, ohne das "Direct 3D9-output" Fenster.
Das Problem hatte ich unter Win7 x64 gelegentlich auch. Es erhärtet sich der Verdacht, dass die Ursache im Video Namen oder im Pfadnamen liegt, denn ich habe mit deinem Script eine Fehlermeldung bekommen, dass ein Film nicht zu öffnen war (obwohl der Pfad und der Name richtig waren). Daraufhin habe ich die beiden Videos in einen anderen Ordner kopiert und in 1.mp4 und 2.mp4 umbenannt und oh Wunder = so hat es funktioniert.
Ich hatte von einem Spezialisten aus dem Video Bereich noch einen Tipp bekommen der da lautet:
Code
ffmpeg -i LeftInput.mp4 -vf "[in] scale=iw/2:ih/2,pad=2*iw:ih [left]; movie=RightInput.mp4,scale=iw/2:ih/2[right];[left][right]overlay=main_w/2:0[out]" -c:v prores output.mov
Damit werden das linke und rechte Video nebeneinander gelegt.
was zwar ein erheblicher Aufwand ist aber interessant kling, weshalb ich es auf jeden Fall mal probieren werde